甘肃东大肛肠医院管理上引进良好的的现代管理理念，进行标准化和规范化管理。严格执行国家省、市、区各种卫生管理规章制度，各职能管理部门不断加强质量安全管理，重视发挥医生的技术特点和丰富经验，防范了医疗纠纷和事故的发生，使患者“治得放心，医得舒心”
医院就诊实行导医引导下的医生与患者“一对一服务”，考虑到术后患者行动不便，为术后患者安全，在每张病床床头安装了紧急呼叫系统;一人一医一诊室，采血处、输液室的特殊设置也完全满足患者对隐私保护的需求。
针对女性痔疮患者遇到男大夫往往感到尴尬、难为情的现象甘肃东大肛肠医院专门开设“男女分诊制”女性患者由女医生专诊、女导医全程陪护，让广大女性患者享受秘密诊疗。
甘肃东大肛肠医院坚持“医院是以患者的利益为出发点，医疗服务以治愈疾病为目的”原则。在诊疗疾病时，必要的检查一项也不能少，不必要的检查一项也不能多。在必要检查项目中，为患者节约每一分钱，尽量不让患者因为费用高而放弃了治疗和康复的机会。
